機房區域的制冷只能采用機房專用的精密空調，這是有原因的，在選擇數據中心制冷系統時，很多數據中心的IT人員認為舒適性空調也可以用于機房的冷卻，并認為舒適性空調能效高，因此可以降低制冷系統的能耗。
但是，在機房中，顯熱負荷幾乎完全由IT硬件、燈光、支持設備和供電產生的顯熱組成。因為幾乎沒有人，室外空氣有限，并且通常經過防潮處理，所以，潛熱非常少。針對這種情況，空調所需的顯熱比非常高，為0.95~0.99。只有機房精密空調可以達到這種非常高的顯熱比。相對而言，舒適性空調的顯熱比通常為0.65~0.70，因此，提供的顯熱量過少，潛熱冷量過多。過多的潛熱冷量一位著將不斷地從空氣中去除水分。為了保持所需的相對濕度范圍45%~50%，將需要不斷加濕，而這肯定要消耗大量的能量。
首先是機房的地理和物理環境，包括機房的面積、高度等以及機房專用精密空調安裝的位置，考慮機房內有多大的空間留給機房專用精密空調，然后選擇相應外觀尺寸的機型，機房專用精密空調室內外機的安裝高度差有要求，所以文位置一定要確定好，尋找合適的安裝地點。同時在選擇時應把投資成本考慮在內，機房專用精密空調制冷系統不同，不同的制冷方式空調對安裝和運行要求有很大不同，用常見的風冷型和水冷型機房專用精密空調舉例來說，風冷型機房專用精密空調相對安裝簡單一點但占地面積大，水冷機房專用精密空調帶有水循環系統，需要安裝防漏水檢測系統，并且對水質要求較高。
其次要考慮的是機房儀器設備的發熱量，從而選擇空調應滿足多大的制冷。同時要考慮機房當地的氣候環境，因為不同的機房專用精密空調對環境溫度濕度的要求是不同的。另外機房專用精密空調選型配置包括后期冗余、運營和維護以及其他特殊要求也是要考慮到。
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